1. شعبة الأنظمة والبرمجيات: تضم هذه الشعبة ثلاث وحدات تتولى تحليل وتصميم الانطمة باستخدام اللغات البرمجية الحديثة، كما تقع على عاتقها تصميم التطبيقات وذلك حسب حاجة مؤسسات الوزارات المختلفة والقطاع الخاص ضمن برنامج التعاون معها. وتتبنى هذا الشعبة بناء ومتابعة قاعدة البيانات المركزية التي تضم البيانات والمعلومات الخاصة بالجامعة.
2. شعبة التدريب والدعم الفني: تسعى هذه الشعبة الى اعداد دراسات واقعية تهدف بالنظر الى مدى حاجة تشكيلات الجامعة الى دورات نوعية تساهم في رفع وتأهيل كوادر تلك التشكيلات كما تتبنى التخطيط للأهداف المستقبلية التي يتبناها مركز الحاسبة الالكترونية. تضم هذه الشعبة وحدتين، تتولى تدريب وتاهيل المشاركين في دورات منهجية يقيمها المركز ضمن البرنامج الأكاديمي المعد سلفا. كما تشكل الحوكمة الالكترونية احدى اهم واجبات هذه الشعبة بالاضافة الى متابعة خدمات الانترنت ومجهزي تلك الخدمات ومتابعة الامور الفنية المتعلقة في المحاضرات الفديوية.
3. شعبة صيانة الحاسبات و الشبكات: تعنى الشعبة بتنفيذ اجراءات بناء شبكة لاسلكية كفوءة داخل الجامعة يتم من خلالها ربط جميع التشكيلات من خلال استثمار كافة الموارد المتاحة. كما وتعنى هذه الشعبة بإدامة الاجهزة الالكترونية والطابعات والحاسبات المحمولة بالاضافة الى صيانة الشبكات الالكترونية وادارتها.
4. شعبة الشؤون الادارية: تعنى هذه الشعبة بإنجاز كافة الاعمال الادارية بالمركز والتنسيق بين الشعب والوحدات المختلفة في تنظيم مواعيد الدورات وتسهيل امور المشتركين فيها، بالاضافة الى انجاز الامور المالية والحسابية والتدقيق المالي الخاص بالمركز . بالاضافة الى تقديم احتياجات المركز من امن وخدمات متنوعة ومختلفة.
5. شعبة الموقع الالكتروني : تعنى هذه الشعبة بتحديث ومتابعة الموقع الالكتروني للجامعة ومواقع تشكيلاتها ، وإنشاء البريد الالكتروني المؤمن ضمن الموقع . كذلك اعطاء المشورة الفنية بخصوص تصميم وتحديث المواقع الالكترونية العائدة للجامعة .